O FUTEBOL CLUBE CESARENSE foi fundado no dia 01 de Janeiro de 1932. O seu 1º Presidente da Direcção foi António Gomes Correia Júnior que, nessa data, liderou um grupo de jovens que fundaram o Clube, grande parte deles integraram a sua primeira de futebol. O primeiro passo foi construir um campo de futebol, no Mergulhão, sendo desde sempre conhecido como Campo do Mergulhão.

 O primeiro jogo oficial foi com a AD Valecambrense e a primeira grande vitória do Clube foi na época 1935/1936 quando venceu o Campeonato de Promoção da AF Aveiro.

 Nessa mesma época, o Cesarense foi pioneiro a nível nacional, não criando uma equipa de futebol feminino mas sim duas equipas, formadas por jovens da freguesia.

 Ao longo dos anos, o Clube viveu momentos bons e momentos menos bons, em algumas épocas passou por muitas dificuldades, quer financeiras quer ao nível dos órgãos sociais, mas conseguiu chegar vivo, com força e dinamismo ao ano de 1982, ano em que comemorou as suas bodas de ouro.

 Na época 1982/1983, por direito próprio e pela 1ª vez, o FC Cesarense sobe aos campeonatos nacionais tendo descido na época 1983/1984, fruto de alguma inexperiência e orçamento baixo.

 Na época 1984/1985 o Clube ascende de novo aos campeonatos nacionais, conseguindo manter-se nesse nível por 3 épocas consecutivas, um enorme feito para um Clube representativo de uma freguesia tão pequena.

Na década de 90 foi criada uma comissão de obras, o velhinho Campo do Mergulhão foi reposicionado e deu-se inicio á construção do Estádio do Mergulhão, uma obra magnifica para a altura e que demorou alguns anos a ser executada.

Em 1991 a AF Aveiro atribuiu ao FC Cesarense o diploma de sócio de mérito, passando também a ser sócio honorário.

Em 1992, ano de comemoração dos 60 anos, o Governo atribuiu a Medalha de Mérito Desportivo. Depois de algumas épocas a disputar de novo os distritais, o Clube sobe de novo á 3ª divisão nacional na época 1996/1997 conseguindo manter-se 9 épocas consecutivas. 

Em 26 de Novembro de 2000 o Estádio do Mergulhão, já com relva natural e luz artificial, é inaugurado pelo Presidente da CM Oliveira de Azemeis, Sr Angelo Azevedo.

Algum tempo depois é inaugurado o campo nr. 2, em terra batida, e um polidesportivo descoberto.

No ano de 2007, na comemoração do 75º aniversário do Clube, foi lançado o desafio de colocar piso sintético no campo nr.2, tendo sido criado uma comissão de obras para o efeito.

No dia 20 de Maio de 2009, é realizado um mega jantar de encerramento de época no relvado do Estádio do Mergulhão, com mais de 400 pessoas, um dos grandes eventos que ficará nos anais da história do Clube.

Na época 2009/2010 o Cesarense sobe á 2ª divisão nacional, conseguindo o feito de em apenas 2 épocas passar dos distritais á 2ª divisão nacional.

 Em Junho de 2010 arrancam as obras de colocação do sintético no campo nr. 2, construção de um túnel de acesso e nasce assim o centro de formação do Cesarense.

Depois de ter descido á 3ªdivisão nacional o Cesarense sobe de novo á 2ª divisão nacional na época 2011/2012 e a recente equipa feminina criada na época anterior ascende ao campeonato nacional feminino e vencendo a Taça Distrito de Aveiro.

 No dia 26 de Maio de 2012, o sintético do campo nr 2 é inaugurado pelo então Presidente da CM Oliveira de Azemeis, Dr Herminio Loureiro.

Na época 2012/2013 a equipa senior feminina realiza um espectacular campeonato nacional vendo duas das suas atletas serem chamadas á selecção nacional, Andreia Norton e Susana Silva. Nesta época o Cesarense foi pioneiro nacional na integração de atletas estrangeiras tendo em consequência a FPF iniciado um processo de aposta clara no desenvolvimento do futebol feminino em Portugal.

 No ano de 2014 foram realizadas obras de requalificação no interior do Estádio do Mergulhão, com melhorias significativas nos balneários, posto médio e outras valências.

 No ano de 2015 foi realizado o primeiro Mundialito CESAZ tendo por padrinho Vitor Baía, tendo também neste ano sido aprovados os novos estatutos do Clube.

 Na época 2015/2026 os Juniores do FC Cesarense são campeões distritais e sobem á 2ª divisão nacional para, na época seguinte, subirem á 1ª divisão nacional, um feito histórico.

Na época 2018/2019 os Iniciados são campeões distritais subindo ao campeonato nacional do escalão, um feito inédito para o Clube.

A década de 2010 seria uma década de ouro para a formação do FC Cesarense onde a qualidade e quantidade das suas equipas eram por demais evidentes.

Nos últimos anos, fruto de alguma instabilidade interna, da cada vez maior dificuldade na angariação de sponsors e do crescimento dos Clubes á sua volta, o FC Cesarense tem evidenciado maiores dificuldades em manter-se a um nível de elevada qualidade e chegar ao 100º aniversário com força e vitalidade.

No entanto, nos dias de hoje, o Clube tem em competição 9 equipas/escalões, desde os Seniores aos Petizes e movimenta cerca de 175 atletas.